論文 on 生物プロセス工学研究室梶田グループ

Physical Review Research に論文が掲載されました（ミトコンドリアの整列）

Mon, 29 Apr 2024 00:00:00 +0000

論文 “Active thermodynamic force driven mitochondrial alignment” が Physical Review Research 6, L022024 (2024) に Letter として掲載されました。doi:10.1103/PhysRevResearch.6.L022024

arXiv にプレプリントを公開しました（ミトコンドリアの整列）

Tue, 09 May 2023 00:00:00 +0000

論文 “Active thermodynamic force driven mitochondrial alignment” のプレプリントを arXiv に公開しました。arXiv:2305.05553

その後、Physical Review Research 6, L022024 (2024) に Letter として掲載されました。doi:10.1103/PhysRevResearch.6.L022024（掲載のお知らせ）

npj Systems Biology and Applications に論文が掲載されました（慢性骨髄性白血病の治療応答予測）

Thu, 13 Oct 2022 00:00:00 +0000

論文 “Early dynamics of chronic myeloid leukemia on nilotinib predicts deep molecular response” が npj Systems Biology and Applications 8, 39 (2022) に掲載されました。doi:10.1038/s41540-022-00248-3

Cancers に論文が掲載されました

Thu, 22 Sep 2022 00:00:00 +0000

論文 “Time-series clustering of single-cell trajectories in collective cell migration” が Cancers 14 (19), 4587 (2022) に掲載されました。doi:10.3390/cancers14194587

同じ学科の藤田聡先生のグループとの共同研究です。上皮間葉転換を起こした細胞と起こしていない細胞を一緒に培養し、繊維状の足場の上を集団で移動する様子をタイムラプス顕微鏡で撮影しました。その動画から一つ一つの細胞の軌跡を取り出し、時系列のクラスタリングで似た移動パターンをもつ細胞を分類する方法を示しました。同じクラスターには上皮系と間葉系の両方の細胞が含まれ、その分かれ方は細胞の位置や分裂と関係していました。

Molecular and Cellular Neuroscience に論文が掲載されました（軸索内ミトコンドリア）

Fri, 04 Feb 2022 00:00:00 +0000

論文 “Intermitochondrial signaling regulates the uniform distribution of stationary mitochondria in axons” が Molecular and Cellular Neuroscience 119, 103704 (2022) に掲載されました。doi:10.1016/j.mcn.2022.103704

bioRxiv にプレプリントを公開しました（慢性骨髄性白血病の治療応答予測）

Wed, 17 Feb 2021 00:00:00 +0000

論文 “Early dynamics of chronic myeloid leukemia on nilotinib predicts deep molecular response” のプレプリントを bioRxiv に公開しました。doi:10.1101/2021.02.17.431221

JRNAL に論文が掲載されました

Wed, 20 May 2020 00:00:00 +0000

論文 “An error correction mechanism for reliable chemical communication systems” が Journal of Robotics, Networking and Artificial Life 7 (1), 52–57 (2020) に掲載されました。doi:10.2991/jrnal.k.200512.011

Chaos に論文が掲載されました（受容体クラスターによるリガンド検出）

Fri, 24 Jan 2020 00:00:00 +0000

論文 “Reliable target ligand detection by noise-induced receptor cluster formation” が Chaos 30 (1), 011104 (2020) に掲載されました。doi:10.1063/1.5140714

細胞内の反応は確率的ですが、細胞は似た分子の多い環境でも標的の分子を確実に検出します。リガンドが引き起こす受容体の確率的なクラスター形成によって、ゆらぎがかえって感度と特異性を高めうることを示しました。この効果は、標的のリガンドが、クラスターが受容体を取り込む協同的な反応を促す場合に生じます。非標的のリガンドが増えても、ゆらぎの強さを調節すれば検出の性能は保たれます。

生産研究に解説が掲載されました（免疫T細胞の抗原識別）

Sat, 30 Mar 2019 00:00:00 +0000

解説「免疫T細胞における抗原分子識別の定量的生物学」が 生産研究 71 (2), 125–132 (2019) に掲載されました。doi:10.11188/seisankenkyu.71.125

Physical Review E に論文が掲載されました（0次超特異性によるリガンド識別）

Fri, 14 Jul 2017 00:00:00 +0000

論文 “Balancing specificity, sensitivity, and speed of ligand discrimination by zero-order ultraspecificity” が Physical Review E 96, 012405 (2017) に掲載されました。doi:10.1103/PhysRevE.96.012405

Biophysics に総説が掲載されました（T 細胞の抗原識別）

Thu, 26 Mar 2015 00:00:00 +0000

総説 “Experimental and theoretical bases for mechanisms of antigen discrimination by T cells” が Biophysics 11, 85–92 (2015) に掲載されました。doi:10.2142/biophysics.11.85

論文 on 生物プロセス工学研究室 梶田グループ